無花果蛋白酶的主要作用原理就是對蛋白質的水解，使多肽水解為低分子的肽，可在清潔類護膚品中使用。無花果蛋白酶對純蛋白的水解能力和順序基本與胰蛋白一致，由於無花果蛋白酶的耐高溫、活性高、穩定性好、對pH的變化不敏感等，比木瓜蛋白酶的應用適用面更廣。